Selasa, 03 Januari 2012

Web atau Link Penyedia Software Dalam Kimia Komputasi


Di bawah ini adalah beberapa link tersebut :

Sumber : http://melinahadera.blogspot.com/2011/12/beberapa-linkweb-penyedia-software-yg.html

Manfaat dari 5 Software dalam Kimia Komputasi

1.      HyperChem berfungsi untuk :
  • Membuat sketsa dwimatra (2D) molekul dari atom-atom penyusunnya, lalu mengubahnya menjadi model trimatra (3D) dengan HyperChem Model Builder.
  • Memilih residu-residu standar secara berurutan dari perpustakaan asam amino dan nukleotida HyperChem/Lite untuk membangun protein dan asam nukleat.
  • Membaca tipe atom dan koordinat molekular yang telah disimpan sebagai arsip HIN (masukan HyperChem yang dibuat sebelumnya) atau arsip ENT (mengambil dari sumber lain, yaitu Brookhaven Protein Data Bank/PDB). 

2.      Chem Office berfungsi untuk :
·         Membuat struktur kimia dengan mudah dan tidak perlu terlalu rumit untuk menggambarkannya
·         Mempermudah kita menggambar rumus kimia. Untukmenggambar rumus molekul kimia Chem Office menyertakan Chem Draw dan Chem 3D.  Chme Draw digunakan untuk menggambar rumus molekul kimia sedangkan Chem 3D untuk menggambar stuktur molekul dalam bentuk 3 dimensi.


3.      Chem Draw ultra 8.0 berfungsi untuk membuat struktur kimia.


4.      Rasmol berfungsi untuk :
Untuk keperluan visualisasi senyawa-senyawa organik atau anorganik tertentu, dapat digunakan software  Rasmol. Akan tetapi hanya dapat untuk visualisasi tanpa dapat digunakan untuk pembuatan atau manipulasi struktur molekul. Software yang dapat digunakan untuk keperluan pembuatan atau manipulasi struktur misalnya adalah HyperChem, Chem3D atau Alchemy.

Sumber : http://iqmal.staff.ugm.ac.id/wp-content/semloktik-2003-iqmal1.pdf

5.      MarvinSKetch berfungsi untuk :

Banyak hal yang bisa dimanfaatkan dari MarvinSketch untuk pengajaran kimia. Gambar dan animasi molekul dapat dibuat dengan mudah. Selanjutnya dapat disisipkan dalam media pembelajaran kimia. Tutorial berupa video untuk mengefektifkan MarvinSkecth dapat dilihat atau diunduh dari sini. MarvinSketch adalah software kimia hanya untuk visualisasi rumus struktur kimia yang gratis, bisa dijalankan di sistem operasi Windows dan Linux juga MacOS. Mau mencicipinya silahkan unduh dari web ChemAxon ini.

Sumber : http://blog-indonesia.com/blog-archive-2090-378.html

Mengenai kimia komputasi

Dalam mempelajari kimia komputasi, banyak yang bisa dilakukan. Mulai dari pembuatan struktur suatu senyawa dan mengetahui dalam proses penelitian serta pembelajaran. Dan banyak pula software yang dapat digunakan dalam kimia komputasi. Dimana kimia komputasi tersebut adalah suatu pembelajaran mengenai ilmu kimia dengan menggunakan bantuan komputer dalam prosesnya.


Dalam Kimia Komputasi juga kita akan bermain-main dengan metode perhitungan matematis yang diimplementasikan dalam sebuah software, mulai dari mekanika molekular (MM), semi empiris dengan seabrek jenis perhitungannya, Density Functional Theory (DFT), Electron Correlation (Mpn, CASSCF, CI dll).

Dan berikut software-software yang dibuat untuk keperluan kimia komputasi seperti GAUSSIAN, HyperChem, NWCHEM, GAMESS, ADF dll. Ada software yang dibuat untuk visualisasi saja seperti RasMol, Molden, GaussView, Molekel, Jmol dll. Ada juga yang dibuat untuk simulasi seperti TurboMole, untuk docking molekular misalnya Autodock dsb. Untuk menggambar struktur ada ChemDraw (bagian dari ChemOffice), ChemSketch, MarvinSKetch dll.